(应龙后来在黄河里被轩辕人皇救出,因此加入了人祖大战,顺利帮轩辕战胜蚩尤,享受着人族神兽的美名归隐山林。)
祖凤再次被打伤选择撤退,另外两族也因为损失大将需要恢复元气没有追击祖凤。
林天和祖凤再次逃回凤凰秘境,在进入凤凰秘境之前,林天的时间彻底用完,在秘境门口被天道驱逐出这个时空。
祖凤有些悲伤,于是在雌凤凰雕像留下了有关林天的信息,顺便用血强化一波大祭司准备的传承。
最后,鲲鹏自己躲在暗处看着祖凤和另外两只神兽做最后的拼死搏斗,祖凤的凤炎和祖麒麟的雷电重创了祖龙。
祖龙受伤不断暴怒试图毁灭他看到的一切,因此惹怒天道降下天雷,肉体被完全粉碎,灵魂被撕裂成九份,形成独立人格散落在世界。
祖凤和祖麒麟两只神兽害怕在洪荒大陆里激战间接破坏大陆惹怒天道,于是两只神兽一边大战一边在往混沌前进。
混沌(即浩瀚的宇宙),在这里战斗不会受到环境影响。祖凤用自己的血脉燃烧了自己还能复活三次的机会,和祖麒麟一起同归于尽。
那场爆炸对混沌来说无关紧要,但是却把两只神兽的肉体焚烧的一干二净,后来的人多次搜寻也无法找到有用的材料。
由于战斗没有胜利者,天道祝福神兽的唯一名额被分解祝福了全洪荒的妖兽,各路妖兽开始取代神兽。
最后,身怀祖凤直系血脉的鲲鹏被多方势力追杀,直到他自己遇上了帝俊和他的仆人海月。
帝俊以妖帝之名创立新世界,鲲鹏是他得力的助手之一。直到有一天,当他得知帝俊想要把他和自己的分身融合时,鲲鹏果断选择跑路。
帝俊得知大怒,与巫族决战前,派出海月和一群高手追杀。高手几乎被鲲鹏杀死,他自己也受了伤,和仅剩的海月一直五五开。
两人一直大战到帝俊在巫族战场陨落,海月心如死灰放弃追杀鲲鹏,带领帝俊仅剩的手下一起自我封印等待帝俊的归来。
巫族同时也因为东皇太一的愤怒几乎灭族,东皇太一作为帝俊的亲弟弟,为了给亲哥报仇,他拉着几个巫族顶尖战力同归于尽。
巫族此后再无强者,蜷缩在冥界缓慢发育,希望恢复种族的巅峰期。
鲲鹏与海月对战多年,他身上留下许多隐伤。经过思考,他选择跑去北荒沙漠里静养,经常吞噬周围的妖兽恢复,这也是北荒生命稀少的原因。